Attesteringsmyndigheden (eller betalingsmyndigheden) har ansvaret for den finanstekniske gennemførelse af programmet. Det er aftalt mellem programmets parter, at denne funktion varetages af:

Region Syddanmark
Regnskab og Finans
DK-7100 Vejle
kontakt@regionsyddanmark.dk
www.regionsyddanmark.dk

Attesteringsmyndigheden har ansvaret for

• programmets fælles euro-konto med programmidlerne,
• udbetaling af tilskud til projekter på grundlag af reviderede regnskaber,
• anmodning om udbetaling af EU-midler fra Bruxelles,
• modtagelse af udbetalinger fra Bruxelles.

Disse funktioner foregår elektronisk gennem en fælles database for de Europæiske Strukturfonde i Bruxelles.

Attesteringsmyndighed har desuden til opgave at kræve tilbagebetaling af uretsmæssigt udbetalte støttemidler hos leadpartner hhv. hos den pågældende danske eller tyske programpartner.